根据不同水分、盐分梯度，将焉耆盆地分为河畔区、荒漠区和湖畔区。调查不同区天然植被种类、数量、盖度等因子与不同水分、盐分的关系，结果表明：河畔区从第一分水枢纽到开都河下游70km范围内，土壤水分无明显梯度变化，土壤盐分、地下水矿物质含量则呈明显增加趋势；随盐分梯度变化，乔、灌、草植被盖度与土壤含盐量呈指数关系；适宜植被生长的地下水埋深范围为0.5~2.4m，当地下水矿物质含量为0.62g/L时，河畔区植被生长最好。荒漠区（西区、南区、北区）从西北到东南方向，土壤水分、盐分均呈增加趋势；不同盐分条件对植被盖度有明显影响，当土壤含盐量在6~10g/kg之间时，随土壤含盐量增加，植被覆盖度降低，植被种类明显减少。湖畔区离湖1~3km范围，随离湖距离增加，土壤水分减小，盐分增大；随土壤含盐量增加，灌、草植被盖度逐渐减小，适宜植被生长的地下水埋深范围为0.5~5.7m；当地下水矿物质含量0.5g/L左右时，湖畔区植被生长最佳；地下水矿物质含量3~5g/L时，盐漠植被仍生长良好。