在界定耕地保护绩效内涵的基础上，基于PSR模型建立耕地保护绩效评价指标体系，运用TOPSIS法和协调度计算函数建构评价模型，以全国31个省级行政区域为样本，对耕地保护绩效进行了综合评价。研究结果表明：①耕地保护PSR系统的协调性反映了耕地保护的“原因－效应－响应”配合程度，可用来度量耕地保护的绩效水平；②耕地保护的PSR系统协调度最高为黑龙江1.6794，最低为海南1.4512，平均协调度1.6100。耕地保护绩效的区域差异明显。耕地保护绩效与区域经济发展外在压力和耕地资源禀赋具有较强的相关性；③在耕地保护制度安排中应遵循耕地保护机会成本和耕地资源禀赋的区域差异，调控地方政府的利益诉求，把土地利用分区和土地利用收益分配相结合，建立区域间的利益补偿机制。同时，强化对耕地保护政策执行力的考核。