针对太湖蓝藻打捞后难以处理并造成严重二次污染的问题，采用厌氧发酵方法研究了蓝藻发酵产生沼气的相关参数、发酵产物的成分、藻毒素降解特点；同时评估了太湖蓝藻无害化处理以及作为生物质能源、肥料的资源化利用可行性。研究结果表明，接种适量活性污泥后太湖蓝藻在厌氧状态下产生沼气达0.56L/g左右，比甲烷速率达189.73L/kg·d，调节碳氮比可以大幅度提高蓝藻产气量和比产甲烷速率。蓝藻发酵产生沼气的CH₄含量虽然处于动态变化，但平均含量较禽畜粪便发酵产生沼气的甲烷含量高，太湖蓝藻是一种有潜力的生物质能源材料。蓝藻藻毒素自然存降解极慢，但采用厌氧发酵后，藻毒素迅速降解。蓝藻发酵后沼液沼渣中含有丰富的氮、磷钾及氨基酸等营养，是一种优质的有机肥。